El hermano de César Acuña, Óscar Acuña Peralta, se encuentra en paradero desconocido tras un operativo de la Fiscalía Anticorrupción en el marco de la investigación del caso Qali Warma. Este programa, que garantiza la alimentación a estudiantes de colegios públicos, está bajo la lupa por presuntas irregularidades en la adjudicación de contratos. El fiscal Reynaldo Abia lideró el operativo, que se llevó a cabo el 19 de noviembre en las regiones de La Libertad, Áncash y Lima. Durante la intervención, las autoridades no encontraron a Óscar Acuña en su vivienda en Trujillo. Se incautaron documentos, equipos y celulares relacionados con la supuesta manipulación de procesos en el programa Qali Warma. Óscar Acuña es investigado por presunto tráfico de influencias y su vinculación con una red criminal que habría favorecido a proveedores del programa. Según la tesis fiscal, Acuña habría recibido S/77.000 de la empresa Frigoinca entre septiembre y diciembre de 2023. Estos pagos, según un colaborador eficaz, se habrían realizado para influir en decisiones de funcionarios regionales y favorecer a la empresa en licitaciones y controles sanitarios. Además, se menciona al exgerente regional de Salud de La Libertad, Aníbal Morillo, quien está acusado de facilitar informes favorables a Frigoinca. La Fiscalía busca esclarecer el rol de cada implicado y determinar si existió una estructura que operó en diversas entidades públicas bajo la protección de actores políticos y administrativos. Acuña ha reconocido haber recibido dinero, pero sostiene que solo fueron entre 10 mil y 15 mil soles, afirmando que el resto lo devolvió. Por su parte, Morillo ha negado cualquier contacto con representantes de Frigoinca. Tras estas irregularidades, el partido Alianza para el Progreso, al que pertenece César Acuña, decidió retirar a Óscar Acuña de la contienda electoral para las elecciones generales de 2026 y anunció una investigación interna.